全转录组(transcriptome)高通量测序-其它资料-资讯-生物在线

全转录组(transcriptome)高通量测序

作者:上海纽科生物科技有限公司 2022-08-01T00:00 (访问量:4565)

全转录组是指细胞转录出来的所有RNA,包括mRNA和非编码RNA。通常我们所说的全转录组测序通常包括对mRNA、lncRNA、circRNA和miRNA的测序。每种RNA分子可以单独分析,也可以联合分析,以更加全面地解析这些RNA分子的表达、差异,调控网络。由于测序成本的降低,越来越多的研究者开始选择全转录组测序。 全转录组测序通过构建两种测序文库:miRNA文库和去核糖体的链特异性文库,一次性分析4种RNA分子(circRNA,lncRNA,mRNA和miRNA),可以揭示它们之间的复杂调控关系。

送样指南

RNA:2 μg
细胞:2x106
动物组织:50 mg
植物组织:500 mg
全血、血清、血浆:2 ml
尿液:50 ml

结果展示

经典案例

1. Yang F, Chen Y, Xue Z, Lv Y, Shen L, Li K, Zheng P, Pan P, Feng T, Jin L, Yao Y. High-Throughput Sequencing and Exploration of the lncRNA-circRNA-miRNA-mRNA Network in Type 2 Diabetes Mellitus. Biomed Res Int. 2020 May 20;2020:8162524
2. Zhu KP, Zhang CL, Ma XL, Hu JP, Cai T, Zhang L. Analyzing the Interactions of mRNAs and ncRNAs to Predict Competing Endogenous RNA Networks in Osteosarcoma Chemo-Resistance. Mol Ther. 2019 Mar 6;27(3):518-530.
3. Zhou T, Li M, Xiao Z, Cai J, Zhao W, Duan J, Yang Z, Guo Z, Chen Y, Cai W, Huang P, He C, Xu F. Chronic Stress-Induced Gene Changes In Vitro and In Vivo: Potential Biomarkers Associated With Depression and Cancer Based on circRNA- and lncRNA-Associated ceRNA Networks. Front Oncol. 2021 Sep 28;11:744251

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