结直肠癌(Colorectal Cancer, CRC)是全世界最常见的癌症之一。在过去的十年中,预防性筛查项目的推广使死亡率大幅下降,然而在许多国家范围内,结直肠癌仍然是癌症相关死亡的第二大原因【1】。
几十年来,癌细胞系和基因编辑小鼠【2】一直是CRC研究的主要模型,人类肿瘤患者衍生异种移植(PDX)也已成为了CRC研究的工具【3】。与此同时,能够在体外进行长期培养的原发性/转移性CRC类器官模型进一步扩大了研究人员的选择范围。类器官既可以像PDX一样代表了个体患者的真实肿瘤情况,又兼具了细胞系的可传代、易于高通量筛选等特性。因此,CRC类器官模型正在广泛应用于药物研究、个性化医疗等领域。
本篇文章基于Nature Chemical Biology【4】、STAR protocols【5】、Nature protocols【6】和Cell【7】发表的四篇文章,整理了人类结直肠癌组织来源的类器官培养方案。
图1. 病人组织来源的CRC类器官研究方案【8】
细胞来源
活检样本或手术样本
培养基配方
组织处理
1. 将新鲜CRC组织样本放入预冷的PBS中,剔除脂肪组织和坏死的肿瘤组织(通常为黄色或白色),只选取活的肿瘤组织(通常为粉红色)。
2. 将CRC组织转移到含有5 mL预冷的PBS溶液中清洗,去除血液和碎片。为防止污染,需要多次重复此步骤至液体变澄清。
3. 吸出PBS,将组织切割为1-2 mm3的小块,此步骤可以留存适量组织用于测序、免疫组化分析等。
4. 将剩余组织块切碎,并加入1 ml预冷的类器官培养基,用p1000吸头将肿瘤碎片悬浮液转移到含有5 ml解离培养基的离心管中,轻轻震荡混匀后,放置于37℃培养箱中解离1 h。每隔15min轻轻震荡或吹打混匀一次。
5. 加入8ml 预冷的DMEM/F12(含10%FBS)终止消化。
6. 将悬浮液经过70μm细胞筛网过滤,收集解离的细胞。
7. 将过滤的细胞悬液在4℃条件下450g离心5min。
8. 若细胞沉淀有明显的红色,则将细胞重悬于5ml的红细胞裂解液中,冰上孵育10min使红细胞裂解。
9. 向细胞悬液中加入5ml DMEM/F12冲洗细胞一次,离心收集细胞沉淀后,加入1-2ml DMEM/F12重悬细胞,并进行台盼蓝染色和细胞计数。
类器官培养
10. 将冻存的Matrigel在4℃下过夜解冻,在冰上以3:1的体积比将Matrigel与细胞悬液混合,轻轻吹打混匀避免产生气泡。
11. 从37℃培养箱中取出预热的24孔板,将80μl混合液接种在各孔中,注意需接种在孔的中心,避免接触侧壁。
12. 将24孔板室温放置5min后,转移至37℃,5%CO2的培养箱中孵育10min,使Matrigel固化。
13. 向每个孔中缓慢滴加650μl 预热的类器官培养基,确保基质胶被完全覆盖。放于37℃,5%CO2的培养箱中培养,每2-3天更换培养基(用于换液的类器官培养基内不含Y27632)。
类器官传代
14. 吸出类器官培养液,机械分离Matrigel,然后加入500μl胰蛋白酶,放置于37℃培养箱中孵育1-2min后,用移液器多次吹打,从基质胶中释放类器官。
15. 用含有10%FBS的DMEM/F12培养基终止消化,在4℃条件下300g离心5min。
16. 用冷PBS清洗后,再次4℃条件下300g离心5min。
17. 将所得沉淀按照1:3-1:5的比例重复10-13步骤(具体比例通过类器官的汇合度确定),完成传代。
类器官冻存
18. 取1-2个孔的类器官,消化离心后取细胞沉淀,加入1ml细胞冻存液。
19. 将细胞重悬后转移至冻存管中,利用程序降温盒缓慢降温至-80℃。
20. 第二天,将样品转移到液氮中长期储存。
类器官复苏
21. 将液氮冻存的CRC类器官放置在37℃水浴锅中进行解冻,水浴时间不宜超过2min。
22. 将细胞悬液转移至15ml离心管中,加入10ml预冷的DMEM/F12培养基(含10% FBS)。4℃条件下300g离心5min,取细胞沉淀。
23. 将所得沉淀重复10-13步骤,完成CRC类器官复苏。
图2. 显微镜下CRC类器官的形态,以及Ki-67、E-Cadherin标记物的表达【5】
利用类器官技术,能够将CRC和正常结直肠组织在体外进行长期扩增,并且在微卫星稳定(MSS)来源的CRC类器官中发现,类器官模型能够保留样本的遗传多样性和形态稳定性【9】。结直肠(癌)类器官的进一步优势包括可以进行建库、细胞异质性研究、实验动物移植、个体患者分析和基因编辑,目前已经成为了疾病建模的优秀工具,未来可能在再生医学领域大放异彩【10】。
图3. 结直肠(癌)类器官在基础和临床研究中的应用【10】
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参考文献
【1】TORRE, Lindsey A., et al. Global cancer statistics, 2012. CA: a cancer journal for clinicians, 2015, 65.2: 87-108.
【2】EVANS, Jonathan P., et al. From mice to men: Murine models of colorectal cancer for use in translational research. Critical reviews in oncology/hematology, 2016, 98: 94-105.
【3】BROWN, Kai M., et al. Patient-derived xenograft models of colorectal cancer in pre-clinical research: a systematic review. Oncotarget, 2016, 7.40: 66212.
【4】TOSHIMITSU, Kohta, et al. Organoid screening reveals epigenetic vulnerabilities in human colorectal cancer. Nature Chemical Biology, 2022, 18.6: 605-614.
【5】BERGIN, Christopher J., et al. Protocol for serial organoid formation assay using primary colorectal cancer tissues to evaluate cancer stem cell activity. STAR protocols, 2022, 3.1: 101218.
【6】FUMAGALLI, Arianna, et al. A surgical orthotopic organoid transplantation approach in mice to visualize and study colorectal cancer progression. Nature protocols, 2018, 13.2: 235-247.
【7】VAN DE WETERING, Marc, et al. Prospective derivation of a living organoid biobank of colorectal cancer patients. Cell, 2015, 161.4: 933-945.
【8】SASAKI, Nobuo, et al. Studying cellular heterogeneity and drug sensitivity in colorectal cancer using organoid technology. Current Opinion in Genetics & Development, 2018, 52: 117-122.
【9】BEHJATI, Sam, et al. Genome sequencing of normal cells reveals developmental lineages and mutational processes. Nature, 2014, 513.7518: 422-425.
【10】BARBÁCHANO, Antonio, et al. Organoids and colorectal cancer. Cancers, 2021, 13.11: 2657.
苏州近岸蛋白质科技股份有限公司,是一家专注于重组蛋白应用解决方案的高新技术企业,主营业务为靶点及细胞因子类蛋白、重组抗体、酶及试剂的研发、生产和销售,并提供相关技术服务。公司定位为医疗健康与生命科学领域原料与技术解决方案的上游供应商,致力于为下游客户提供及时、稳定、优质的产品及服务,助力全球生物医药企业和研究机构的技术与产品创新升级。
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