自7月20日南京禄口机场检出阳性病例至今,传播链已经波及安徽、广东、四川、广东、辽宁、北京、湖南、湖北等多个省市。7月30日上午,南京市疾控中心通报称,目前已完成的本土疫情病例的病毒基因测序工作确定均属于德尔塔(Delta)毒株;病毒基因组序列高度同源,提示是同一个传播链。
目前,全疫情球形势依然严峻,新冠病毒变异总体呈现加快的趋势,国家卫健委已明确要求对所有输入新冠肺炎病例开展病毒基因测序,这将有助于我国对病毒变异株的监测。
突变株的强大传播能力
5月11日世卫将Delta毒株加入了需要关切(of concern)的标签,目前有该标签的毒株一共有四种,分别是:
最早在英国发现的毒株B.1.1.7—阿尔法(Alpha)
最早在南非发现的毒株B.1.351—贝塔(Beta)
最早在巴西发现的毒株P.1—伽玛(Gamma)
最早在印度发现的毒株B.1.617.2—德尔塔(Delta)
其中Delta变异株的传播有多夸张呢?据世卫组织6月21日公布的内容,Delta变异株变异毒株已传播至全球92个国家,并且依然在全球迅速蔓延。
曾有数据表明在一周内英国99%的新增确诊病例感染的都是Delta,在俄罗斯莫斯科,89.3%的新冠肺炎患者体内也都发现Delta,德国疾控机构罗伯特·科赫研究所所长也指出,最迟将在今年秋季,Delta大概率会成为德国境内的主流毒株。
近日美国华盛顿邮报WaPo发布的美国CDC相关资料中显示Delta突变株的基础传染值(R0)达5-9.5,远超过原始毒株1.5-3.5的传染性,传播速度超过了MERS,SARS等。
菁良解决方案
综上所述Delta非常有可能取代Alpha,成为全世界范围内的主导病毒株。在此基础上,接下来的防疫任务可能会进一步的加重,一旦发现有Delta变异株规模化的流行,流行病学调查,核酸检测频次都会呈指数级加量。
新冠疫情防控中最重要的一环就是新冠核酸检测,目前针对新冠病毒突变株的大量研究表明,突变株在S蛋白(尤其RBD区域)上发生了突变,但这些突变不会影响以新冠病毒基因的开放读码框lab(ORFlab),核蛋白(N)以及小包膜蛋白(E)等基因为引物和探针的核酸检测试剂的检测能力。
但是目前市面上可供选择的检测体系较为庞杂,所以针对变异株检测筛查及常规核酸检测,该如何保质高效完成,实验室对于检测体系的检测能力进行确认或验证尤为重要。
试剂盒的选择
对核酸提取富集程度及试剂盒的最低检测限进行匹配
核酸提取
对核酸纯度及效率进行确认与验证
扩增阶段
进行最低检测限、精密度、扩增效率等的确认或验证
另外实验室的质量控制也需落实到位,选择合适的质控品以监测和控制实验室检测的准确性。菁良不仅有COVID-19 假病毒全基因组质控品满足常规核酸检测需求,还可以提供众多突变株相关质控品给大家用来评估突变株检测能力。
COVID-19 假病毒全基因组质控品
产品编码 | 产品名称 | 靶值 |
GW-CRBM001-1 | COVID-19 假病毒全基因组质控品 | 1000 copies/颗 |
GW-CRBM002 | COVID-19 假病毒全基因组质控品II | 3000 copies/颗 |
包含2019-nCov病毒全基因组假病毒质控品,可适配市场上所有获批核酸检测试剂盒的质控需求;
产品形式为假病毒,能从采样步骤开始质控检测的全流程;
冻干珠的产品形式,具有更好的稳定性,可常温下运输,可在2-8℃稳定保存12个月;
突变株相关质控品现货
新冠病毒的变异一直都在发生,这无疑会使新冠疫情的防控变得更为复杂。为了能在疫情发生的第一时间及时溯源,落实防控措施并终止变异毒株的传播,突变株的检测同样至关重要。
目前菁良可提供的相关变异株现货产品列表如下:
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最后希望大家能够将摘掉的口罩重新戴回去,并通过有效的疫苗接种,构筑免疫屏障,减少病毒传播复制的机会,为疫情防控增添一份力量。
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