表观遗传是在基因组序列不变的情况下,可以决定基因表达与否并可稳定遗传下去的调控密码,包括DNA的甲基化修饰,组蛋白修饰,表观遗传学主要研究这些“表观遗传密码”的建立和维持机制,及其如何决定细胞表型和个体发育。基因组学的发展可以对生物体所有基因进行集体表征和定量化,研究其相互作用关系对生物体的影响,其中基因组测序和分析便是研究基因组表观修饰机理的一个重要手段。
ATAC-seq,全称Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughout sequencing,即转座酶可接近染色质测序,是一种创新的表观遗传学研究技术。ATAC-seq的核心技术酶--转座酶Tn5可以把DNA序列进行随机打断并连接测序接头,打断的DNA产物经过后续提取与PCR扩增,得到直接用于Illumina测序平台的二代测序文库。
2013 年以来,PubMed 上与 ATAC-seq 直接关联文章搜索达 6,800 余篇,其中不乏 Nature、Science 等头部期刊杂志。2022年,来自近岸蛋白的表观遗传研究系列产品已助力数十篇文章成功发表,其中ATAC-seq技术被广泛应用于各个领域的研究,涵盖细胞调控和分化,染色质状态变化和基因同源重组等。
ATAC-seq技术具有泛用性,可以应用于多种模式生物和各种机制研究,因此ATAC-seq技术越来越受到广大科研人员的关注,很多相关问题也应运而生。表观遗传学研究该怎么设计实验?实验技术怎么选择?ATAC-seq实验怎么做效果好?建库和测序技术怎么选择?如何进行数据处理和结果分析?
针对以上热门科研问题,我们非常荣幸地邀请到了中山大学丁俊军教授、诺禾致源高级产品经理丁晓敏以及近岸蛋白产品应用技术专家马胜,分别围绕染色质调控机制、ATAC-seq生信数据分析和应用案例解析以及实验技术和操作细节等主题,分享前沿研究进展和研究心得。讲座预约通道已开启,欢迎报名参加,获取更多关于表观遗传学研究的前沿动态。
本次云论坛的演讲主题
1.干细胞命运的染色质三维结构调控
2.ATAC-seq技术生信数据挖掘点与应用案例解析
3.ATAC-seq技术方案与实验操作
直播时间
2023年03月29日 19:00-20:50
直播日程
扫描海报二维码,提前注册参会,“近岸蛋白”公众号将在讲座开始前通知您参会。
演讲嘉宾简介
丁俊军
中山大学教授、博士生导师
2009年6月毕业于北京生命科学研究所,获理学博士学位。后于2009年9月开始在美国西奈山医学院进行博士后研究至2015年底。研究工作主要集中在胚胎干细胞、体细胞重编程和早期胚胎发育的相分离、表观遗传和染色质高级结构的调控机制,以及利用iPS细胞建立肿瘤疾病模型等生物医学领域,已在国际著名期刊以通讯或第一作者发表论文12篇(IF>20的5篇),包括Nature、Cell Stem Cell(两篇)、Cell Research(两篇)、Genome Biology、Stem Cell Reports、Protein Cell等,成果被Nature Structural & Molecular Biology杂志评为年度关键进展。
丁晓敏
北京诺禾致源科技股份有限公司 高级产品经理
毕业于华南农业大学国家重点实验室兽医药理学专业,具有多年科研项目管理经验,曾任职诺禾致源研究合作中心项目经理,现任职全球科服产品中心高级产品经理,致力于表观遗传与调控领域产品与技术的研发与推广,包括但不限于ATAC-seq、CUT&Tag、Hi-C、翻译组等众多热点产品。
马胜
苏州近岸蛋白质科技股份有限公司 产品应用技术专家
毕业于武汉大学,生物学专业,发表SCI论文2篇。曾从事NGS产品研发工作。2019年加入近岸蛋白后,负责产品的对外培训和技术支持工作。实地指导CUT&Tag和ATAC-seq实验数十场,具有丰富的产品应用经验。