标题党Dr.S又来啦,不过每次的文章都能收到读者们积极的反馈Dr.S还是很欣慰的,所以再接再厉为大家奉上一个轻松发表高分SCI论文的热门思路。
光使用基因芯片,全基因组关联分析,二代测序等技术进行高通量相关基因筛选就能发表高分文章的时代我们还历历在目,一转眼一场新的革命就要来了。通过前面机种方法筛选得到的仅仅是可能相关的基因,到底有没有功能还不知道呢,有的课题组花了老本用于测序,得到一堆所谓的关键基因,无从下手。现在已经进入功能基因研究的年代了,基因没有功能怎么让审稿人和编辑高兴呢。不用怕,功能基因筛选的新技术这不是来了吗。下面两幅图相信各位看官都不会陌生吧,是张峰博士课题组连续两年在顶级杂志上发表的使用CRISPR-CAS9及其改进技术进行的A375细胞中vemurafenib(PLX)药物的药敏/耐药基因筛选工作。
几乎是一模一样的思路,只是方法从CAS9 Loss-of-Function(LOF)筛选换成了SAM Gain-of-Function(GOF)筛选。 关于两篇文章的详细思路解读请点这里 , 关于 SAM 的技术介绍请点这里 。 是不是有点灌水的感觉。别急,相同思路的文章正在逐步发表。下面我们来看看哪些领域可以使用 CAS9 或 SAM 技术来高通量筛选功能基因轻松发文章。下面两篇文章分别做的是能够调控炭疽病度和西尼罗河病毒感染的基因。
思路与张峰的两篇文章一模一样,构建大约77000多个sgRNA病毒,组成一个病毒文库,病毒文库可以针对20121个人类的基因,将这个文库感染一大盘的细胞,调整好感染量,确保大部分细胞中只有一个基因被敲除。接着使用致命的炭疽或西尼罗河病毒感染这些基因敲除处理的细胞,将存活下来的细胞进行深度测序获得富集的sgRNA,正是因为这些sgRNA成功的将目的基因敲除了,所以导致了细胞即使被感染上了致命的病毒也能存活下来,那么这些基因就有可能成为治疗这些病毒感染的有效药物靶点。
怎么样,看了这些文章我们是不是也能敏锐的发现些什么呢? 对,没有赶上做个GWAS就能发Nature Genetics的年代,这次总算又碰上好时候了。 不管是研究肿瘤增殖关键基因,耐药基因,病毒感染领域,或者其他领域,只要研究的方向是关于细胞生或者死的,就可以用这个方法进行啊!有这么多癌种,这么多药物,这么多致病的病毒,选择一个细胞系一个药物或一种病毒进行一次高通量功能基因的筛选,得到的基因可以每个深入研究,获得的种子基因或许可以用于后续5~10年的研究。而且别人做了CAS9 LOF研究的还能用SAM GOF再筛选一次,还在等什么,再等文章就被别人发掉了!
吉凯基因能够提供您高质量的CAS9及SAM靶点病毒库,帮助您快速进行功能基因筛选,祝您早日发表高分SCI论文!