VAHTS Dual UMI UDI Adapters Set 1 – Set 4 for Illumina(适配于Illumina高通量测序平台的DNA文库构建试剂盒)
产品名称: VAHTS Dual UMI UDI Adapters Set 1 – Set 4 for Illumina(适配于Illumina高通量测序平台的DNA文库构建试剂盒)
英文名称: VAHTS Dual UMI UDI Adapters Set 1 – Set 4 for Illumina
产品编号: N351/N352/N353/N354
产品价格: 0
产品产地: 南京
品牌商标: 诺唯赞(Vazyme)
更新时间: null
使用范围: null
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VAHTS® Dual UMI UDI Adapters Set 1 – Set 4 for Illumina
低频突变检测利器
检测低至0.1%低频突变:助力低频突变检测,配合深度测序,有效挖掘低频突变信息
降低标签跳跃和错配:双端唯一配对UDI,极大降低标签错配
1. 检测低至0.1%低频突变:
以肿瘤SNV 0.1% ctDNA标准品(含11个已知的突变位点)为模板,使用N351-N354和I*公司同类产品进行建库,捕获后上机测序,下机数据质量与I*公司同类产品相当。使用GATK4和Vardict两款软件进行低频突变分析,对0.1%低频突变的检出优于I*公司同类产品。
图1. 下机数据质量及0.1%低频突变检出
2. 基于测序的交叉污染质控:
N351-N354接头在出厂时均进行了基于测序的严格质控,避免交叉污染。使用单一片段建库后进行测序,UDI标签与单一片段连接的正确率可以达到99.99%,相对于单端接头标签错配率大大降低。
单端接头 | N351-N352 | N353-N354 |
图2. 基于测序的交叉污染质控
VAHTS® Dual UMI UDI Adapters Set 1 - Set 4 for Illumina是适配于Illumina高通量测序平台的DNA文库构建试剂盒。试剂盒中VAHTS® Dual UMI Adapters for Illumina为不完整的双端UMI-Y型接头,可兼容多种A-T连接的文库构建试剂盒。在接头连接后,Insert DNA两端分别添加上5 - 6 nt的Unique Molecular Identifier(UMI),可用于检测低频突变。此外,试剂盒中的VAHTS® UDI Primer for Illumina包含特异性搭配的Unique Dual Index(UDI),经文库扩增后,可实现两个完全独立Index双重检验,最大限度降低标签跳跃和错配(Index hopping & Index misassignment),从而保证最终进入分析流程的reads最接近样品的真实情况。
本套试剂盒由Set 1 - Set 4组成,每个Set中均包含24种不同VAHTS® UDI Primer for Illumina以及 VAHTS Dual UMI Adapters for Illumina。
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组分 | N351(96 rxns) | N352(96 rxns) | N353(96 rxns) | N354(96 rxns) |
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VAHTS® UDI Primer for Illumina(UDI 001 - UDI 024) | 20 μl/each |
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VAHTS® UDI Primer for Illumina(UDI 025 - UDI 048) |
| 20 μl/each |
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VAHTS® UDI Primer for Illumina(UDI 049 - UDI 072) |
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| 20 μl/each |
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VAHTS® UDI Primer for Illumina(UDI 073 - UDI 096) |
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| 20 μl/each |
VAHTS® Dual UMI Adaptersfor Illumina | 480 μl | 480 μl | 480 μl | 480 μl |
单个DNA文库DNA Adapter使用量依据起始模板投入量而定,具体使用浓度可参考附录。
-30 ~ -15℃保存,≤0℃运输