VAHTS Universal Pro DNA Library Prep Kit for Illumina(包含FFPE DNA修复模块的Illumina高通量测序平台文库构建试剂盒)
产品名称: VAHTS Universal Pro DNA Library Prep Kit for Illumina(包含FFPE DNA修复模块的Illumina高通量测序平台文库构建试剂盒)
英文名称: VAHTS Universal Pro DNA Library Prep Kit for Illumina
产品编号: ND608
产品价格: 0
产品产地: 南京
品牌商标: vazyme
更新时间: null
使用范围: null
- 联系人 :
- 地址 : 南京市经济技术开发区红枫科技园C2栋
- 邮编 : 210000
- 所在区域 : 江苏
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- 邮箱 : wangminwen@vazyme.com
VAHTS® Universal Pro DNA Library Prep Kit for Illumina
高效修复DNA损伤: 有效修复碱基损伤、切刻、缺口和3’端封闭等问题
建库效率高: 文库转化率和扩增产出双提升
模板兼容性广: 兼容 gDNA,FFPE DNA,cfDNA,Amplicons 等样本
完美兼容不同质量样本: DNA修复酶对不同DIN值的FFPE DNA均有极佳的表现
建库耗时短: 单个文库构建最短仅需90min
1.FFPE损伤类型以及Vazyme FFPE DNA修复混合液的修复能力
FFPE样本损伤类型 | 是否可以被FFPE DNA修复酶混合液修复 |
胞嘧啶脱氨成尿嘧啶 | 是 |
切刻和缺口 | 是 |
碱基氧化 | 是 |
3’端封闭 | 是 |
DN**段化 | 否 |
DNA-蛋白交联 | 否 |
2.高效修复碱基损伤
以FFPE样本为模板,参照各公司建库流程进行文库构建,使用HiSeq X10 PE150进行测序。结果显示,VAHTS® Universal Pro DNA Library Prep Kit for Illumina(Vazyme #ND608)的高效修复功能使得碱基异常突变数量显著低于同类产品及Vazyme常规DNA建库产品(Vazyme #ND607),性能卓越。
图1.ND608与其他公司同类型产品及ND607,碱基异常突变数量统计对比
3.建库效率高,完美兼容FFPE、gDNA等样本
(1) 高效的文库转化率
以等量的片段化DNA和FFPE DNA为模板,参照各公司建库流程构建PCR-Free文库,再进行qPCR文库定量。VAHTS® Universal Pro DNA Library Prep Kit for Illumina(Vazyme #ND608)相比同类产品和Vazyme常规DNA建库产品(Vazyme #ND607)在文库转化率上表现更优越,确保了文库的丰富度。
图2.ND608 与其他公司同类型产品及 ND607,有效文库产出对比
(2)优越的文库扩增效率
以等量的片段化DNA和FFPE DNA为模板,参照各公司建库流程进行文库构建,用Qubit检测文库浓度。结果表明 VAHTS® Universal Pro DNA Library Prep Kit for Illumina(Vazyme #ND608)在相同的循环数下比同类产品及Vazyme常规DNA建库产品(Vazyme #ND607)文库产量有了极大的提高;在相同产量下比其他公司同类产品所需循环数可减少2~3个cycles,从而降低了高循环数引入的扩增偏好性。
图3.ND608与其他公司同类型产品及ND607,文库产出对比
4.显著提升测序数据质量
以300 ng小鼠FFPE DNA为模板,参照各公司建库流程进行文库构建,使用HiSeq X10 PE150进行测序,测序深度3×。结果显示,VAHTS® Universal Pro DNA Library Prep Kit for Illumina(Vazyme #ND608)在测序数据质量上较同类产品及Vazyme常规DNA建库产品(Vazyme #ND607)表现更优越。
图4.ND608与其他公司同类产品及ND607,测序数据质量分析
VAHTS® Universal Pro DNA Library Prep Kit for Illumina是包含FFPE DNA修复模块的Illumina高通量测序平台文库构建试剂盒。本试剂盒可以将100 pg - 1 μg Input DNA转换成Illumina平台专用文库。本试剂盒包含DNA损伤修复模块,能够有效修复福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)导致的DNA损伤,如胞嘧啶脱氨、切刻和缺口、碱基氧化、3’端封闭等,同时兼容普通DNA样本,不会影响正常DNA样本文库质量。通过对末端修复模块、连接模块和文库扩增模块的整体改进,使文库转化率和扩增文库产出大幅提升,广泛适用于多种样本的PCR或PCR-Free文库构建,且兼容靶向捕获流程。试剂盒中提供的所有试剂都经过了严格的质量控制和功能验证,最大程度上保证了文库构建的稳定性和重复性。
组分 | ND608-01 (24 rxn) | ND608-02 (96 rxn) |
DNA Damage Repair Enzyme | 48 μl | 192 μl |
End Prep Buffer | 240 μl | 960 μl |
End Prep Enzyme | 120 μl | 480 μl |
Rapid Ligation Buffer 2 | 600 μl | 4 × 600 μl |
Rapid DNA Ligase | 120 μl | 480 μl |
VAHTS® HiFi Amplification Mix | 600 μl | 4 × 600 μl |
PCR Primer Mix 3 for Illumina | 120 μl | 480 μl |
Control DNA (264 bp,50 ng/μl) | 10 μl | 10 μl |
-30 ~ -15℃保存。-20 ~ 0℃运输。