VAHTS Total RNA-seq (H/M/R) Library Prep Kit for Illumina(去除核糖体rRNA,适合lncRNA分析)-文库及构建-试剂-生物在线
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VAHTS Total RNA-seq (H/M/R) Library Prep Kit for Illumina(去除核糖体rRNA,适合lncRNA分析)

VAHTS Total RNA-seq (H/M/R) Library Prep Kit for Illumina(去除核糖体rRNA,适合lncRNA分析)

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产品名称: VAHTS Total RNA-seq (H/M/R) Library Prep Kit for Illumina(去除核糖体rRNA,适合lncRNA分析)

英文名称: VAHTS Total RNA-seq (H/M/R) Library Prep Kit for Illumina

产品编号: NR603-01/02

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产品产地: 江苏南京

品牌商标: Vazyme

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包含Ribo-Off® rRNA depletion module, 可去除人、小鼠、大鼠、牛、狗、马、鸡、猴、猪、斑马鱼等物种的核糖体RNA

链特异性建库

优化的大片段建库方案

图1. Ribo-Off®模块去除rRNA原理示意图。

图2. 使用Ribo-Off®模块去除rRNA总共耗时不超过2小时,其中操作时间仅需10分钟以内。

图3. 1 μg universal human reference RNA分别用Oligo dT磁珠纯化mRNA或者用Ribo-Off®模块去除rRNA后构建文库,用Hiseq 2500测序。数据与人类基因组数据库hg19进行比对。可以看到, Ribo-Off®模块可以更有效地去除rRNA,并可保留更多的非编码RNA信息。

VAHTS® Total RNA-seq (H/M/R) Library Prep Kit for Illumina适用于起始模板为0.1-1 μg的人、小鼠、 大鼠总RNA的链特异性转录组文库构建。与常规mRNA-seq文库构建不同的是,本试剂盒将rRNA (包括细胞质28S, 18S, 5S rRNA以及线粒体12S, 5.8S rRNA)从总RNA中去除,保留mRNA以及其它非编码RNA,可用于lncRNA等非编码RNA的分析。降解的RNA样本也可用本试剂盒进行文库构建。 在第二链cDNA合成时,掺入dUTP标记第二链; PCR前将标记的第二链模板用UDG酶消化,使得最终的测序信息都来自于第一链cDNA,从而保留了RNA的链方向性。测序后的数据分析可确定转录本是来自正义还是反义DNA链。

所有组分均在-20°C保存。

适用范围

起始模板:0.1–1 μg人、小鼠、大鼠总RNA。

转录本信息:

本试剂盒适合于针对mRNA和所有除rRNA以外的非编码RNA的链特异性RNA-seq分析,包括基因表达、单核苷酸变异 (single nucleotide variation),可变剪切/融合基因、目标转录组分析等。